近年来，香格里拉市以全面实施好“河长制”为契机，多措并举开展农村水环境综合整治。
进一步提高认识，强化责任担当。将抓好农村水环境综合治理作为扎实推进乡村振兴战略、持续改善农村人居环境的重要内容，以钉钉子的精神，高标准、高质量、高效率推进水环境综合治理工作落到实处、取得实效；以河长制为引领，坚持问题导向，举一反三、综合施策，及时采取针对性措施，不断完善长效机制，创新治理模式，强化监管力度，加快推进水环境提升工程项目实施和污水处理站建设，着力提高农村生活污水处理能力，有效改善水环境质量；加强协调配合，强化监督考核，细化、量化任务分工，明确治理标准和完成时限，实现同心同向发力，持续推进水环境综合治理工作。
全面推进清洁水源、清洁家园、清洁田园行动，以生活污水处理、生活垃圾处理为重点，综合整治农村水环境，推进美丽宜居乡村建设。按照农村生活垃圾治理有齐全的设施设备、有成熟的治理技术、有稳定的保洁队伍、有长效的资金保障、有完善的监管制度的“五有”要求，加快推进农村生活垃圾、重点村庄污水治理工作，推进生态养殖和种植结构调整，开展河道库塘清淤疏浚。据介绍，到2020年，全市规模化畜禽养殖配套建设废弃物处理设施比例将达到70%以上，基本实现乡镇污水处理和生活垃圾处理设施全覆盖，95%的村庄垃圾将得到有效治理。